Cell- och molekylärbiologi, distans, VT 2008
080121- 080222 Molekylärbiologi avsnitt.
Lärare är Per Sunnerhagen, Marie Kannius, Jeanette Nilsson. Jeanette tar emot och fördelar frågor till de övriga.
Läsanvisningar:
Essential Cell Biology (B. Alberts med flera), Second ed. Garland Publishing Inc. ISBN 9780815334811
Kap 5 , Kap 6, Kap 7 (sid 229-258, 262-265), Kap 8 (sid 267-281), Kap 10
1. Definiera följande begrepp: ”antiparallell”, ”baspar”, ”komplementär sekvens”, ”denaturering av DNA/RNA”, ”renaturering av DNA/RNA”, ”dubbelhelix”, ”genom”, ”5’-ände resp. 3’-ände av en nukleinsyra”, ”bidirektionell replikation”
2. Innehåller humana celler cirkulära DNA-molekyler? Motivera svaret.
3. 20 % av alla kvävebaser i DNA från ett visst djur är cytosin. Hur stor andel utgörs av de andra kvävebaserna (adenin, guanin, tymin)?
4. DNA från bakteriofagen M13 innehåller 25 % adenin, 33 % tymin, 22 % cytosin och 20 % guanin. Hur kan man förklara detta förhållande?
5. Vilken kemisk skillnad mellan RNA och DNA är det som gör DNA till en mycket mer stabil molekyl än RNA?
6. Vad är ”änd-replikationsproblemet?
7. Beskriv skillnaderna mellan prokaryoter och eukaryoter vad gäller:
a) genomstorlek
b) organisation av gener
c) intergeniska utrymmen
d) transkript
e) splicing
f) transkription/translation
8. Beskriv nukleosomens uppbyggnad (eukaryoter) och nämn något om de post-translationella modifieringar dess komponenter kan genomgå.
1. Redogör för hur transkriptions-initiering går till hos prokaryoter
2. Efter transkription av RNA polymeras II gener (eukaryoter) sker tre huvudsakliga modifieringar av det primära transkriptet. Beskriv dessa och förklara innebörden av modifikationerna.
3. Beskriv och förklara, gärna med bild, hur translationselongeringen går till. A,P och E site skall finnas med.
4. Beskriv translationsinitieringen hos
prokaryoter
eukaryoter
5. Du har isolerat nedstående mRNA molekyl och vet att den innehåller starten på proteinet. Rita ut läsramarna och avgör vilken som är den rätta.
GGAUGCCUUAAGACAU
6. Vad betyder ”aktivering av tRNA”?
1. I en flercellig organism finns det ett stort antal olika celltyper. Trots att de skiljer sig mycket åt innehåller de identiskt DNA. Hur vet man det? Hur har man gått tillväga för att visa det?
2. Redogör för hur kromatinstrukturen kan påverka initiering av eukaryotisk transkription.
Kap 10
1. Vilka roller spelar restriktionsenzym, vektorer och värdceller inom rekombinant DNA studier.
2. Den humana insulin genen innehåller flera introner. Nu vill man använda sig av bakterier för att producera stora mängder insulin. Problemet är att bakterier inte har introner kan därför inte ta hand om dessa på rätt sätt. Förklara hur man ändå kan komma runt detta och få bakterier att producera humant insulin.
3. Du har just tillverkat världens första genomiska bibliotek ifrån okapi, en nära släkting till giraffen. Ingen gen från dess genom har tidigare blivit isolerad eller beskriven. Du vill nu isolera b-globin genen från ditt bibliotek. Det du vet är att denna gen har isolerats hos människa och nukleotidsekvensen och aminosyrasekvensen för det humana proteinet finns tillgängligt i databaser. Genom att använd den information som finns om den humana genen kan man använda olika strategier för att isolera genen ifrån okapi, beskriv två olika tillvägagångsätt.